İç filtre mekanik temizlik, dış filtre için biyolojik filtrasyon veya temizlik yapar diyoruz.

İki tane aynı kapasitede olan 600lt/h lik iç ve dış filtreyi ele alalım. İç filtrenin pompa ya da impeller emiş deliği çapı ile dış filtre boru emiş çapları aynı olur. (tetra tec 600'ün impel deliği ile 600lt'lik herhangi iç filtreyi karşılaştırın) aradaki fark önemsiz sayılacak kadar azdır. Biraz daha emiş hattına yaklaştığımızda dış filtre boru emiş süzgecinin yüzey alanı ile iç filtredeki plastik kabının dışındaki emiş alanı(emiş ızagara alanları) da birbirlerine çok yakınlar. Şimdi aynı kapasiteyle çeken iki makine, emiş yüzey alanları aynı, mekanik süzgeci yapacak süngerler aynı, çıkış debisi aynı, temizleyecekleri maddelere yakınlık aynı ama bir içerde direk suyun içinde diye mekanik yapıyor diğer dışarda diye aynı mekanik temizliği yapamıyor. 

Dış filtre dediğimiz cihazın içinde sadece karbondur, subtrattır yok bakterilerin yerleşmesi için plastik toplardır olsa da sünger olmasa diyeceğim tamam partikülleri süzemiyor sadece biyolojik filtrasyon yapıyor. Ama durum öyle değil. 

Dış filtrede, filtre kabının içinde olan sünger süzgeci çıkarsam akvaryumun içindeki emiş borusunun içine uygun şekilde soksam sonra da bir mühendislikle impelleri de alsam hemen suyun içinde çevirsem; biyolojik filtrasyon ekipmanlarını ise impellerden sonraya koysam, öyle bir cihaz yapsam, iç filtrenin mekaniğinden ne farkı kalacak.